清朝入关后，效仿明朝制度，正式设立总督、尚书两个官职。尚书掌管中枢部院，总督管辖几个省份或地区的军政大权。以权势而言，它们都极为重要。

在起初设立时，总督跟尚书并没有太大区别，官员对于这两个官职，也算是一视同仁。如果仔细区分的话，尚书比总督更受欢迎。因为尚书是朝廷从一品官职，总督只是正二品官职。跟总督需要应对各地复杂环境不同，尚书作为京官，许多事情可以按照规章制度办事，按部就班，一般不会出什么差错，公务上也没有那么繁杂。

而总督因为偏重于军务，需要应对的事情更多一些。但是，随着时间演变，总督相比尚书，开始逐渐成为更多清朝官员的首选。这种变化并非没有缘由。

从历史源头追述，明朝最初设立总督，本是为了让他们到地方处理某些特殊任务，临时设立的职位。后来任务短时间无法完成，总督就常驻地方，慢慢也有自己的衙门公署。但是，明朝总督仍不算正式官职。清朝入关后，才将总督正式纳入官职。因为继承时并不完善，总督的职权辖区问题都没有解决。所以清朝从顺治到乾隆年间，一直对总督进行调整。

总督设立的初衷，便是让它掌管地方军政大权。可是如果按照正二品官阶的身份，很多公务都无法完成。所以清朝不断给总督增加职权，抬高官阶。 从雍正年间开始，总督挂衔兵部尚书兼都察院右都御史成为惯例，这两个职位都是从一品。

由此，总督在级别上跟尚书便没有太大区别。不过到清朝中后期，总督比尚书更有权力。尚书虽跻身中枢六部，但实权一直受限。

顺治年间有议政王大臣会议，朝廷中枢权力都在那些八旗贵族手中。康熙继位后，虽然废除议政王大臣会议，但又以翰林出身为主的南书房掌握权力。

到了雍正年间，朝廷设立军机处，朝廷六部正式沦为办事机构。对于尚书而言，它的职权只能取决于是否加入这种中枢部门，获得朝廷决议的机会。否则只能算执行机构。

而总督不同。在清朝历史中，总督权力不断上涨。尤其是清朝后期，总督权力渗透到军权、财政、外交以后，它们成为清朝地方最有实权的官职，甚至完全超过原本掌管八旗军的驻防将军和都统。

所以，同级别的情况下，担任总督比担任尚书更有实权。况且山高皇帝远。清朝的时候，朝廷把一干亲王皇族都集中在北京，在北京担任官职，一品官员也得随时收敛。可是在地方当官，即便七品小官，也能耍出官威。所以才有“县官不如现管”的说法。

总督不仅比尚书有权，更比尚书有钱。清朝入关后，为提倡满汉官员平等， 选择以官阶等级作为官员俸禄的标准，唯一区分在于文官跟武官的收入，各有一套体系，但总体仍是以官阶作为划分。可是，清朝官员的收入并非一成不变，它随着不同时期历史的需要，做出相应改变。

清朝的官员俸禄体系，基本继承明朝，对官员给予的待遇并不算高。以朝廷所给予的俸禄，官员只能满足日常所需。

如果社会风气崇尚节俭，倒也不足为患，要是社会崇尚奢侈，必然会引起官场贪奢的风气。清朝就是如此。官员为了敛财，大肆贪污。

雍正继位时，清朝腐败严重 ，虽然以诸多手段惩治贪官，但毕竟不是长效的办法。所以，雍正皇帝决定以高薪养廉的方式，引导解决官员腐败问题。起初以有资格领养廉银的官员只有部分官员，到乾隆年间又改为地方官领养廉银，京官领恩俸。

养廉银的数额是正常俸禄的十倍乃至上百倍，恩俸只有双倍，两相比较， 高下立见。尚书这样的高级京官虽然每年也能拿到地方官巴结的孝敬，可跟总督相比，毕竟差了一截。

总督一般都能领上万两养廉银。尚书如果只领双俸，每年也不过360两白银，相差太多。所以，在多种因素的刺激下，清朝官员也更乐意担任总督这样有权又有钱的官职。

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